第1部分第2部分第3部分
正文种痘要旨选苗蓄苗天时择吉调摄禁忌可种不可种水苗种法五脏传送之理旱苗种法痘衣种法痘浆种法信苗补种自出治法
肠痈急劳走马牙疳西法化验倒视痧秽宜嚏、过饱宜吐痧症、鼠疫寒包暑热久咳、风温咳风寒二便不通神昏谵语（一）用药分量胎黄鼻衄湿温、疝气、风疹、热入血室、阳明经白虎证、天花、时气肝气为湿热所遏 痘不化浆神昏谵
脏腑经络先后病脉证治第一湿病脉证第二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证治第五血痹虚劳病脉证治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七奔豚气病脉证治第八胸痹心痛短气病脉证治第九腹满寒疝宿食病
湿热病篇
脉诀阐微
序上卷妇女之病九十一症，治法七十九方第一 经前第二 月经后第三 月经或前或后第四 月经血虚发热第五 经闭发热第六 行经气血作痛第七 经来不止第八 经来如黄水第九 经来如绿水第十 经来全白色第十一 经来
序上卷妊娠妊娠恶阻妊娠子烦子痫子悬子肿子气子淋转胞胎漏胎动妊娠心痛妊娠中恶妊娠腰腹痛妊娠心腹胀满妊娠数堕胎妊娠羸瘦胎动欲产妊娠咳嗽妊娠伤寒妊娠时疫妊娠热病妊娠疟疾妊娠霍乱妊娠泻泄妊娠痢疾瘦胎妊娠鬼胎下
普济本事方续集
卷上详注灵枢素问伏气化温诸条详注难经伏气发温诸条详注仲景伏气化温证治各条附注仲景暴感暑热证治各条附注仲景兼感湿温证治各条卷中辨正周禹载温热暑疫各条辨正蒋问斋医略伏邪篇辨正张石顽伤寒绪论温热各条辨正吴又