序一序二卷上疗发背痈疽灸法用药第一痈疽备论第二痈疽灸法论第三骑竹马灸法第四论隔蒜灸得效第五背疽肿漫寻头灸法第六蒜饼施用分其轻重第七灸法要论第八痈疽灼艾痛痒论第九脑疽灸法第十痈疽既灸服药护脏腑论第十一马
卷第一孔志约序梁·陶隐居序合药分剂料理法卷第二诸病通用药疗风通用风眩头面风中风脚弱久风湿痹贼风挛痛暴风瘙痒伤寒大热劳复温疟中恶霍乱转筋呕大腹水肿肠下痢大便不通小便淋小便利溺血消渴黄胆上气咳嗽呕吐痰饮宿
自叙绪说卷一石膏赤石脂硝石、芒硝甘草黄人参沙参桔梗知母白术黄连黄芩柴胡白藓皮龙胆芍药牡丹卷二木香补骨脂姜黄、郁金荆芥薄荷青蒿夏枯草漏芦麻黄麦门冬瞿麦葶苈车前子蓄大黄附子、天雄、乌头半夏荛花菟丝子五味子
血證論卷一 陰陽水火氣血論卷二 吐血卷三 汗血卷四 便血卷五 瘀血卷六 癆瘵卷七卷八 方劑
上品卷第一玉屑玉泉丹砂水银空青曾青白青扁青石胆云母朴硝硝石矾石芒硝滑石紫石英白石英青石脂赤石脂黄石脂白石脂黑石脂太一禹余粮禹余粮青玉白玉髓璧玉合玉石陵石碧石青五羽石石流青石流赤六芝赤箭龙眼猪苓茯苓茯神
金匮方歌括
广嗣纪要
备急灸法景宋本
马序王序一夏序王序二曹序许序陶序秦序丁甘仁先生别传卷一伤寒案风温案暑温案湿温案痉症案卷二霍乱案泄泻案痢疾案疟疾案喉痧案附∶白喉案附∶痧后案卷三中风案类中案神志案内伤杂病案附∶不寐案附∶肝气肝阳案附∶头
缪序卷一一、卒尸二、痹三、？（痉）四、痿五、厥六、伤寒六经余证七、大头肿痛（附:蛤蟆瘟）蛤蟆瘟八、霍乱九、瘟病十、伤暑十一、疟十二、疸十三、劳（劳极 烦热 劳瘵）劳极烦热劳瘵卷二十四、热十五、吐衄下血